Nexus CGH - Accélérez vos analyses de nombres de copies
NEXUS CGH est un puissant outil simple d’utilisation pour analyser et visualiser les données de CGH array. Nexus permet une analyse du nombre de copies pour des échantillons de différentes plateformes, différentes expériences…fournissant une analyse des fréquences de gains et pertes, les valeurs de signification statistiques, une analyse de comparaison par groupe et un clustering génomique.
Nexus CGH est véritablement un produit innovant qui améliore vraiment votre productivité par rapport aux autres solutions informatiques. Voyez quelques unes des fonctionnalités ci-dessous et contactez-nous pour une démonstration personnalisée du logiciel avec vos propres données.
Fonctionnalités
| Plateforme Indépendant | Identifiez les régions communes d'abérrations |
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Directement compatible avec les puces commerciales
Possibilité d'intégrer plusieurs types pour en même temps
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Nexus CGH permet la création d'un diagramme de fréquence montrant quel pourcentage de la population sélectionnée possède une aberration de nombre de copie ( Copy Number Aberration (CNA)). L'outil "Tri" permet à l'utilisateur de classer les échantillons selon la présence et la taille de la CNA à un emplacement donné |
| Allez jusqu'à l'échantillon individuel | Visualisez rapidement gènes et régions d'intérêt |
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| En un clic de souris, obtenez toutes les données de sondes et une visualisation cytogénétique de votre échantillon individuel |
Indiquez dans le champ de recherche un symbole de gène ou une région génomique et Nexus zoomera instantanément sur cette région, vous montrant les aberrations génomiques pour vos échantillon à cet emplacement
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| Signification statistique | Visualisez les profils de nombres de copies entre les groupes |
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| Identifiez les régions ayant une CNA statistiquement significative à une valeur-p spécifiée en un seul clic. Exportez ces régions ou visualisez en détails les gènes et fonctions biologiques impliquées. |
Visualisez simultanément les profils de nombres de copies pour tous les groupes d'échantillons (par exemple différents types de tumeurs) avec le profil de l'ensemble de données complet. Passez la souris sur le profil et affichez le pourcentage d'échantillons ayant un call à cette aberration spécifique.
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| Identifiez les régions ayant une signification statistiques selon les groupes | Visualisez les régions présentant des différences significatives |
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Créez une paire de groupes d'échantillons et réalisez un test statistique entre les groupes pour trouvez les régions statistiquement significatives . Par exemple, identifiez les régions ayant des profils de CNA différents entre les échantillons jeunes et malades contres les échantillons sains et âgés.
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Créez un graphe spécifique pour vos comparaisons par paires de groupes avec les régions de différences significatives affichées. |
| Accédez à toutes les annotations en un seul clic | Réalisez une Analyse d'Enrichissement |
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Pour chaque région d'intérêt, créez un rapport avec les annotations, listes de gènes, de fonctions, d'ontologie de gènes, informations sur les sondes...en un simple clic
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Identifiez les processus biologiques , fonctions moléculaires et composants cellulaires qui peuvent être affectés par des changement de nombres de copies |
| Cluster d'échantillon basés sur les changements génomiques | Vidéo de démonstration en ligne |
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| Cluster d'échantillons basé sur les profils CNA de chaque échantillon. Clustering hiérarchique ou k-means |
Découvrez la facilité d'utilisation de Nexus! |
