K3XL
Robot de picking et de gestion des clones bactériens à haut débit
Vue générale du système
L’instrument K3XL a été développé pour être flexible et multi applications avec une grande simplicité d’utilisation. Equipé d’axes électromagnétiques (X, Y et Z), les déplacements de la tête de travail sont rapides et précis (1 micon).
Le K3XL dans son application de picking de colonies intègre une caméra couleur pour l’imagerie, une table lumineuse ThinPick, un logiciel spécifique pour optimiser la détection puis sélectionner les colonies en fonction de multiples critères (couleur, forme, proximité, …).
Les colonies sont alors récupérées grâce à un outil équipé de 96 pins éjectables pour être déposées automatiquement dans des microplaques au format SBS (96, 384 ou 1536 puits).
La plateforme K3XL offre également la possibilité de passer d’une application de picking à une application de réplication, réarrangement ou gridding simplement et efficacement grâce à l’ajout/remplacement d’un simple outil et, éventuellement d’accessoires (support de membranes pour le gridding).
Caractéristiques générales du K3XL
- Stockage des Boîtes et Microplaques (Source & Destination)
Un stacker Tray-Hive pour Bio-Assay trays (Boîte 22cm x 22cm) : l’instrument K3XL est équipé du stacker Tray-Hive d’une capacité de 6 Bio-Assay Tray (22x22cm) avec une gestion automatique des couvercles et lecture des codes barres. Le stacker Tray-Hive peut également recevoir tout type de microplaques au format SBS (du format low profile au format Deep-Well), ou des boîtes de petri (diamètre compris entre 9cm et 21cm). La gestion automatique des couvercles ainsi que la lecture des codes-barres sont également effectives et automatique pour l’ensemble de ces formats..
Deux Stackers Plate-Hive pour microplaques : l’instrument est équipé de deux lignes de Stacker Plate-Hive pour microplaques au format SBS et format Deep-Well intégrant la gestion automatique des couvercles et la lecture des codes barres. Chaque ligne peut recevoir jusqu’à 140 microplaques. La capacité totale est donc de 280 microplaques pour les deux lignes (ou 2x30 Deep-Well). Chaque ligne Plate-Hive est équipée d’un lecteur code barre pour le tracking des microplaques en cours de run et gère automatiquement les couvercles sans faire intervenir la tête.
Station de lavage automatique: l’instrument K3XL est équipé d’une station de lavage automatique. Les outils sont déposés au début de la station et progressent en fonction des cycles programmés, pour ensuite être récupérés par la tête afin de poursuivre les opérations en cours.
Applications réalisées par l’instrument K3XL
Le Picking
L’instrument K3XL offre la possibilité d’imager, d’analyser et de prélever des colonies (bactéries, levures) à partir d’un large choix de formats sources (le plus grand format étant le format Bio-Assay tray 22cmx22cm) et de déposer les organismes dans des microplaques (format SBS 96, 384, 1536 puits, Omnitray ou Deep-Well). Pour cette application, un logiciel dédié au picking permet de programmer et de réaliser l’ensemble de ces tâches. Lors d’un run, et en fonction du choix de l’utilisateur, l’instrument peut également effectuer directement un duplicat sur deux microplaques successivement.
L’instrument K3XL est équipé d’un plateau lumineux ThinPickÔ permettant un éclairage puissant et stable par le fond des boîtes grâce à un système exclusif de LED et filtre de dispersion. Ceci permet de distinguer entre autre, les colonies par différence de contraste entre la lumière diffusant à travers le milieu de culture et les colonies. Cette information est détectée par la caméra couleur et le logiciel d’analyse pour isoler les colonies.
Sur l’instrument K3XL, l’acquisition des images s’effectue grâce à une caméra CCD couleur RGB ajoutant ainsi un paramètre complémentaire de détection et de sélection par la couleur réelle des colonies.
- Picking en fluorescence (OPTION)
L’instrument K3XL offre également la possibilité d'analyser l'image et de sélectionner des colonies intégrant des marqueurs fluorescents.
Grâce à des filtres (spécifiques de la longueur d’onde de travail) positionnés au niveau de la table lumineuse et sur la caméra, il devient possible d’identifier des colonies émettant dans une longueur d’onde définie, de les sélectionner puis de les récupérer.
Le Gridding sur membranes
L’instrument K3XL est en mesure de spotter sur membranes grâce à un outil 96, 384 ou 1536 pins spécifique et au logiciel de programmation des patterns de spotting.
Grâce à des supports (Arraying Filter-Blocks) installés en quelques minutes sur la zone de travail, il est possible de disposer jusqu’à 6 membranes au format 22cm x 22cm sur la zone de spotting. Les microplaques sources (format 96 ou 384 puits ou 1536 puits) sont disposées dans les lignes de stackers Plate-Hive (capacité totale de 280 microplaques). Notez qu’il est possible de recharger les hôtels en cours de run si le nombre total de microplaques nécessaires pour les spotting dépasse les 280.
La densité de spotting peut aller jusqu'a une grille maxi de 10x10 (outil 96 pins) ; 6x6 (outil 384 pins) ; 3x 3 (outil 1536 pins) en six champs et ce, sur un total de 6 membranes.
L’instrument K3XL peut donc réaliser sans aucun problème des spotting sur membranes 22cm x 22cm avec une densité de 55296 clones en duplicat.
La Réplication
L’instrument K3XL est en mesure de réaliser des opérations de réplication sur des microplaques et/ou Deep-Well au format SBS (96, 384, 1536 puits) grâce à l’utilisation des deux lignes de stacker Plate-Hive, des lecteurs de codes barres et du logiciel dédié.
Grâce à l’utilisation des deux lignes de stacker Plate-Hive, du Tray-Hive et du logiciel dédié, l’instrument K3XL offre à l’utilisateur la possibilité de réaliser un large panel de réplication à très haut débit et sans intervention pendant un run.
Il est toutefois possible de recharger les hôtels en cours de run si le nombre total de microplaques nécessaires pour la réplication dépasse la capacité maximale des hôtels.
Le Réarrangement
L’instrument K3XL est en mesure de réaliser des opérations de réarrangement sur des microplaques et/ou Deep-Well au format SBS (96, 384, 1536 puits) grâce à l’utilisation des deux lignes de stacker Plate-Hive, des lecteurs de codes barres et du logiciel dédié.
Notez qu’il est également possible d’utiliser le stacker Tray-Hive en association avec les Plate-Hive pour effectuer des réarrangements en fonction de l’opération à réaliser.
Le système peut accepter dans un format CSV une liste prédéterminée de réarrangement à réaliser. Si la liste est supérieure à la capacité des lignes de stacker, le logiciel invitera l’utilisateur à compléter les hôtels en cours de run.
Exemple de chargement du K3XL pour la réplication
Source |
Destination |
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Plate-Hive (1 à 140 microplaques) |
=> |
Plate Hive (1 à 140 microplaques) |
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Plate-Hive (1 à 140 microplaques) |
=> |
Plate-Hive (1 à 30 Deep-Well) |
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Plate-Hive (1 à 30 Deep-Well) |
=> |
Plate Hive (1 à 140 microplaques) |
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Plate-Hive (1 à 30 Deep-Well) |
=> |
Plate-Hive (1 à 30 Deep-Well) |
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Tray-Hive (1 à 12 microplaques) |
=> |
Plate Hive (1 à 280 microplaques) |
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Tray-Hive (1 à 12 microplaques) |
=> |
Plate-Hive (1 à 60 Deep-Well) |
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Tray-Hive (1 à 12 Deep-Well) |
=> |
Plate Hive (1 à 280 microplaques) |
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Tray-Hive (1 à 12 Deep-Well) |
=> |
Plate-Hive (1 à 60 Deep-Well) |
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Notez que le stacker Tray-Hive peut également être utilisé comme destination
